Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms