Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP54P61011 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP54P61011 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP54P61011 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP54P61011 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP54P61011 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP54P61011 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP54P61011 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP54P61011 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP54P61011 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP54P61011 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP54P61011 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP54P61011 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP54P61011 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP54P61011 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP54P61011 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP54P61011 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP54P61011 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP54P61011 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP54P61011 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP54P61011 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP54P61011 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRP54P61011 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRP54P61011 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRP54P61011 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRP54P61011 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SRP54P61011 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRP54P61011 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms