Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBP2P56545 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms