Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPAP53621 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPAP53621 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPAP53621 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPAP53621 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPAP53621 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPAP53621 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPAP53621 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COPAP53621 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPAP53621 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPAP53621 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPAP53621 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPAP53621 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COPAP53621 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COPAP53621 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPAP53621 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPAP53621 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPAP53621 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPAP53621 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPAP53621 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPAP53621 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPAP53621 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPAP53621 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPAP53621 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPAP53621 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPAP53621 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPAP53621 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPAP53621 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPAP53621 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPAP53621 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPAP53621 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPAP53621 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPAP53621 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPAP53621 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPAP53621 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPAP53621 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPAP53621 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPAP53621 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPAP53621 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPAP53621 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPAP53621 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPAP53621 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPAP53621 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPAP53621 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPAP53621 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPAP53621 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPAP53621 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
COPAP53621 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
COPAP53621 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
COPAP53621 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
COPAP53621 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
COPAP53621 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPAP53621 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms