Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP5P51878 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP5P51878 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP5P51878 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP5P51878 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP5P51878 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP5P51878 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP5P51878 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP5P51878 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP5P51878 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP5P51878 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP5P51878 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP5P51878 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP5P51878 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP5P51878 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP5P51878 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP5P51878 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP5P51878 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP5P51878 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP5P51878 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP5P51878 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP5P51878 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP5P51878 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms