Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR4P51679 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR4P51679 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR4P51679 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR4P51679 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR4P51679 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR4P51679 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR4P51679 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR4P51679 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR4P51679 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR4P51679 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR4P51679 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR4P51679 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR4P51679 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR4P51679 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR4P51679 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR4P51679 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR4P51679 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR4P51679 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR4P51679 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR4P51679 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR4P51679 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR4P51679 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR4P51679 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR4P51679 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR4P51679 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR4P51679 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR4P51679 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR4P51679 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR4P51679 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms