Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPAP49450 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPAP49450 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPAP49450 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPAP49450 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPAP49450 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPAP49450 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPAP49450 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPAP49450 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPAP49450 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPAP49450 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPAP49450 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPAP49450 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPAP49450 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPAP49450 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPAP49450 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPAP49450 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPAP49450 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPAP49450 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPAP49450 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPAP49450 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPAP49450 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPAP49450 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPAP49450 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPAP49450 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPAP49450 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPAP49450 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPAP49450 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPAP49450 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPAP49450 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPAP49450 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPAP49450 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPAP49450 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPAP49450 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPAP49450 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPAP49450 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPAP49450 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPAP49450 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPAP49450 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPAP49450 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPAP49450 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPAP49450 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPAP49450 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPAP49450 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPAP49450 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPAP49450 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPAP49450 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPAP49450 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPAP49450 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPAP49450 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPAP49450 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPAP49450 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPAP49450 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPAP49450 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPAP49450 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPAP49450 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPAP49450 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPAP49450 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPAP49450 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPAP49450 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPAP49450 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms