Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms