Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RECQLP46063 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RECQLP46063 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RECQLP46063 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RECQLP46063 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RECQLP46063 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RECQLP46063 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RECQLP46063 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RECQLP46063 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RECQLP46063 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RECQLP46063 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RECQLP46063 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RECQLP46063 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RECQLP46063 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RECQLP46063 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RECQLP46063 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RECQLP46063 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RECQLP46063 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RECQLP46063 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RECQLP46063 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RECQLP46063 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RECQLP46063 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RECQLP46063 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RECQLP46063 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RECQLP46063 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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