Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZEB1P37275 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZEB1P37275 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZEB1P37275 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZEB1P37275 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZEB1P37275 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZEB1P37275 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZEB1P37275 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZEB1P37275 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZEB1P37275 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZEB1P37275 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZEB1P37275 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZEB1P37275 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZEB1P37275 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZEB1P37275 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZEB1P37275 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZEB1P37275 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZEB1P37275 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZEB1P37275 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZEB1P37275 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZEB1P37275 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZEB1P37275 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZEB1P37275 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZEB1P37275 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZEB1P37275 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZEB1P37275 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZEB1P37275 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZEB1P37275 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZEB1P37275 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZEB1P37275 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms