Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms