Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms