Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TSPOP30536 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TSPOP30536 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms