Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms