Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR2AP28223 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms