Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA3P26006 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms