Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms