Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF3P17036 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms