Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms