Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG2P13727 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms