Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEFHP12036 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEFHP12036 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEFHP12036 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEFHP12036 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NEFHP12036 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEFHP12036 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEFHP12036 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEFHP12036 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEFHP12036 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEFHP12036 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEFHP12036 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEFHP12036 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEFHP12036 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEFHP12036 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEFHP12036 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEFHP12036 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEFHP12036 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEFHP12036 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEFHP12036 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEFHP12036 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEFHP12036 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEFHP12036 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEFHP12036 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NEFHP12036 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEFHP12036 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NEFHP12036 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NEFHP12036 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NEFHP12036 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NEFHP12036 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEFHP12036 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEFHP12036 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEFHP12036 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEFHP12036 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEFHP12036 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEFHP12036 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEFHP12036 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEFHP12036 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEFHP12036 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEFHP12036 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEFHP12036 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEFHP12036 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NEFHP12036 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NEFHP12036 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NEFHP12036 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEFHP12036 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEFHP12036 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEFHP12036 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEFHP12036 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEFHP12036 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEFHP12036 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEFHP12036 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEFHP12036 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEFHP12036 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEFHP12036 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEFHP12036 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEFHP12036 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NEFHP12036 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NEFHP12036 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEFHP12036 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEFHP12036 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEFHP12036 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEFHP12036 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms