Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A1P11836 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms