Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTPCP11686 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPCP11686 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPCP11686 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPCP11686 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTPCP11686 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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SFTPCP11686 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SFTPCP11686 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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SFTPCP11686 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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SFTPCP11686 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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SFTPCP11686 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
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SFTPCP11686 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPCP11686 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SFTPCP11686 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SFTPCP11686 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPCP11686 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPCP11686 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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