Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DMDP11532 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DMDP11532 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DMDP11532 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DMDP11532 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DMDP11532 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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