Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms