Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD2O96028 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD2O96028 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD2O96028 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD2O96028 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD2O96028 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD2O96028 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD2O96028 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD2O96028 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD2O96028 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD2O96028 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD2O96028 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD2O96028 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD2O96028 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD2O96028 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD2O96028 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD2O96028 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD2O96028 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD2O96028 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD2O96028 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD2O96028 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD2O96028 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD2O96028 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD2O96028 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD2O96028 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD2O96028 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD2O96028 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD2O96028 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD2O96028 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD2O96028 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD2O96028 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD2O96028 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD2O96028 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD2O96028 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD2O96028 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD2O96028 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD2O96028 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD2O96028 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD2O96028 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD2O96028 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD2O96028 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD2O96028 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD2O96028 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD2O96028 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD2O96028 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD2O96028 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD2O96028 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD2O96028 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD2O96028 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD2O96028 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD2O96028 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD2O96028 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD2O96028 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD2O96028 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD2O96028 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD2O96028 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD2O96028 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD2O96028 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD2O96028 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD2O96028 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD2O96028 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSD2O96028 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSD2O96028 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSD2O96028 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSD2O96028 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSD2O96028 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSD2O96028 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSD2O96028 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSD2O96028 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSD2O96028 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSD2O96028 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSD2O96028 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSD2O96028 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSD2O96028 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSD2O96028 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSD2O96028 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSD2O96028 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSD2O96028 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSD2O96028 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSD2O96028 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSD2O96028 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSD2O96028 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSD2O96028 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSD2O96028 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSD2O96028 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSD2O96028 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSD2O96028 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSD2O96028 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSD2O96028 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSD2O96028 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSD2O96028 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSD2O96028 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NSD2O96028 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSD2O96028 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSD2O96028 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSD2O96028 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSD2O96028 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSD2O96028 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NSD2O96028 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSD2O96028 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms