Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms