Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR1AO95602 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms