Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPAG9O60271 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPAG9O60271 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
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