Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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