Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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HOXA3O43365 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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HOXA3O43365 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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HOXA3O43365 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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HOXA3O43365 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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HOXA3O43365 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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HOXA3O43365 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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