Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms