Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBDO15205 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBDO15205 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms