Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUX2O14529 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUX2O14529 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUX2O14529 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUX2O14529 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUX2O14529 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUX2O14529 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUX2O14529 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUX2O14529 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUX2O14529 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUX2O14529 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUX2O14529 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUX2O14529 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUX2O14529 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUX2O14529 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUX2O14529 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUX2O14529 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUX2O14529 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUX2O14529 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUX2O14529 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUX2O14529 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUX2O14529 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUX2O14529 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUX2O14529 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUX2O14529 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUX2O14529 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUX2O14529 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CUX2O14529 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUX2O14529 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUX2O14529 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUX2O14529 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUX2O14529 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUX2O14529 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUX2O14529 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUX2O14529 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUX2O14529 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUX2O14529 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CUX2O14529 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUX2O14529 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUX2O14529 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUX2O14529 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUX2O14529 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUX2O14529 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUX2O14529 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUX2O14529 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CUX2O14529 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUX2O14529 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUX2O14529 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUX2O14529 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUX2O14529 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUX2O14529 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUX2O14529 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUX2O14529 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUX2O14529 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUX2O14529 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUX2O14529 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUX2O14529 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUX2O14529 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CUX2O14529 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUX2O14529 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUX2O14529 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUX2O14529 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUX2O14529 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CUX2O14529 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUX2O14529 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CUX2O14529 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CUX2O14529 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CUX2O14529 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CUX2O14529 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CUX2O14529 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CUX2O14529 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CUX2O14529 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CUX2O14529 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CUX2O14529 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CUX2O14529 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CUX2O14529 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CUX2O14529 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CUX2O14529 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CUX2O14529 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CUX2O14529 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CUX2O14529 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CUX2O14529 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CUX2O14529 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CUX2O14529 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CUX2O14529 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CUX2O14529 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CUX2O14529 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CUX2O14529 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CUX2O14529 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CUX2O14529 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CUX2O14529 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CUX2O14529 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CUX2O14529 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CUX2O14529 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CUX2O14529 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CUX2O14529 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CUX2O14529 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CUX2O14529 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUX2O14529 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUX2O14529 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms