Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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