Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4E171 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4E171 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4E171 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4E171 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4E171 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4E171 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4E171 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4E171 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
B4E171 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4E171 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4E171 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4E171 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4E171 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
B4E171 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4E171 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms