Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRCP1A6NGW2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms