Protein–RNA interactions for Protein: A4IF30

SLC35F4, Solute carrier family 35 member F4, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35F4A4IF30 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC35F4A4IF30 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms