Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms