Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms