Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms