Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms