Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNFSF18Q9UNG2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms