Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGXB4Q9UGU5 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms