Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FAM8A1Q9UBU6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FAM8A1Q9UBU6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM8A1Q9UBU6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms