Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms