Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms