Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms