Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RDH8Q9NYR8 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RDH8Q9NYR8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RDH8Q9NYR8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RDH8Q9NYR8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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RDH8Q9NYR8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RDH8Q9NYR8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RDH8Q9NYR8 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RDH8Q9NYR8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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