Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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MIS18AQ9NYP9 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MIS18AQ9NYP9 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
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